Modelamiento in silico de la proteína transmembranal abc (YXDM) posiblemente involucrada en la transducción de señales relacionadas con la resistencia a antibióticos

Abstract

La resistencia a antibióticos o antimicrobianos es definida como la capacidad que tiene un microorganismo para sobrevivir al ataque de un medicamento antibiótico al que inicialmente era vulnerable. Existen muchos organismos resistentes dentro de los cuales encontramos bacterias, hongos, virus y algunos parásitos los cuales pueden soportar ataques de medicamentos antimicrobianos como lo son los antibióticos, antimicóticos y antivirales, ocasionando así una disminución en la eficiencia de las terapias farmacológicas tradicionales desencadenando infecciones persistentes y además aumentaría el riesgo de propagación. Los transportadores Casete de unión a ATP ABC por sus siglas en inglés (ATP binding cassette) son proteínas especializadas en el transporte activo a través de la membrana celular. Estos transportadores contribuyen conjuntamente a respuestas de adaptación a los cambios ambientales bacterianos, la proteína yxdM pertenece a la familia ABC4 y es caracterizada como una quinasa por su actividad transmembranal en la expulsión de toxinas. Esta investigación propone el modelamiento in silico de la proteína yxdM la cual podríaasociarse con la respuesta del Bacillus subtilis a algunos antibióticos, usando como herramienta base la bioinformática que consiste en el uso de instrumentos de análisis los cuales facilitan la optimización de la estructura terciaria de dicha proteína.

The antibiotic or antimicrobial resistance is defined as the ability of a microorganism to survive the attack of an antibiotic drug that was initially vulnerable. Many resistant organisms within which are bacteria, fungi, viruses and some parasites which can withstand attacks of antimicrobial drugs such as antibiotics, antifungals and antivirals, thereby causing a decrease in the efficiency of traditional drug therapies triggering persistent infections and also increase the risk of spreading The ATP-binding cassette transporters ABC for its acronym in English (ATP binding cassette) are specialized proteins in active transport through the cell membrane. These carriers jointly contribute to adaptive responses to bacterial environmental changes, yxdM ABC4 protein belongs to the family and is characterized as a transmembrane kinase activity for its expulsion of toxins. This research proposes modeling in silico protein yxdM which could be associated with the response of Bacillus subtilis to some antibiotics, using as a basic tool bioinformatics consisting of the use of analytical tools which facilitate the optimization of the tertiary structure of said protein.