Predicción de la interacción que realiza el péptido FV2-16 del veneno del escorpión Tityus Macrochirus (Buthidae) sobre la metaloproteasa - 2 presente en la línea celular del cáncer de cérvix (HeLa)

Abstract

La Metaloproteasa-2 (MMP-2) está sobreexpresada en el cáncer de cérvix, por lo que inhibirla es un objetivo terapéutico en los últimos años para el control de la invasión y metástasis tumoral. El presente proyecto tuvo como objetivo predecir la interacción que realiza el péptido FV2-16 del veneno de escorpión Tityus macrochirus (Buthidae) sobre la MMP-2 presente en la línea celular (HeLa) derivada del cáncer de cérvix por medio de herramientas bioinformáticas. Se identificó el código PDB de la MMP-2 asociado al código 1CK7, se realizó la caracterización fisicoquímica y funcional del péptido identificando que es polipéptido clasificado como molécula de gran tamaño y con un punto isoeléctrico neutro, se realizó la caracterización funcional y estructural del ligando donde se reconoció actividad sobe canales iónicos y una homología con la clorotoxina del 50% que permite asociar una actividad adicional sobre la MMP-2; posteriormente se realizó la predicción de la estructura del ligando y la identificación de los residuos activos del receptor pata su posterior acoplamiento molecular por medio de HADDOCK. Las 2 interacciones más fuertes identificadas son las de tipo puente salino, sin embargo, se identificaron 18 interacciones más (12 de tipo convencional y 6 hidrofóbicas), la inhibición del péptido FV2-16 sobre la MMP-2 se puede deber a su actividad sobre el dominio catalítico. El péptido FV2-16 aislado del Tityus Macrochirus se clasifica como inhibidor del dominio catalítico, con interacciones biológicamente significativas que, tras un proceso de desarrollo, se podría esperar que se presente como un medicamento biológico inyectable.

Metalloprotease-2 (MMP-2) is overexpressed in cervical cancer, so inhibiting it, is a therapeutic target in recent years for the control of tumor invasion and metastasis. The present project aimed to predict the interaction that the FV2-16 peptide from the scorpion venom Tityus macrochirus (Buthidae) performs on MMP-2 present in the cell line (HeLa) derived from cervical cancer by means of bioinformatics tools. The PDB code of MMP-2 associated to the 1CK7 code was identified, the physicochemical and functional characterization of the peptide was performed, identifying that it is a polypeptide classified as a large molecule with a neutral isoelectric point, the functional and structural characterization of the ligand was performed, where activity on ion channels and a homology with chlorotoxin of 50% was recognized, which allows associating an additional activity on MMP-2; Subsequently, the structure of the ligand was predicted and the active residues of the receptor were identified for subsequent molecular docking by means of HADDOCK. The 2 strongest interactions identified are salt-bridge type, however, 18 interactions more were identified (12 conventional and 6 hydrophobic), the inhibition of the FV2-16 peptide on MMP-2 may be due to its activity on the catalytic domain. The FV2-16 peptide isolated from Tityus Macrochirus is classified as a catalytic domain inhibitor, with biologically significant interactions that, after a development process, could be expected to be presented as an injectable biologic drug.