Estudio computacional del complejo ACE2:Proteına pico Sars Cov 2 con compuestos derivados de principios activos encontrados en plantas medicinales aprobadas en Colombia

Abstract

La proteína S (CTD-S) del Sars Cov 2 actua como conductor de entrada del ARN viral a la celula por medio de la ACE2 con la que interactua, continuando con el proceso de replicación viral. CTD-S tiene posibles sitios de union cercanos a la zona de interacción con la ACE2 que pueden cambiar la estructura de la proteına e inhibir su función, convirtiéndose en blanco de estudios de ligantes de bajo peso molecular derivados de plantas medicinales, enfocándose en el diseño de fármacos para el tratamiento del COVID-19. En el presente trabajo se realizo un estudio In Silico de los derivados estructurales de compuestos extraídos de plantas medicinales, que están relacionados a tratamientos de enfermedades virales respiratorias, utilizándolos como posibles ligantes del CTD-S empleando acoplamiento molecular utilizando el programa Autodock Vina. Se encontraron afinidades de unión relativamente altas, en residuos cercanos a la zona de interacción, prediciendo los mejores complejos ligante-receptor y validandolos también con los índices de Fukui.

The Protein S (CTD-S) of Sars Cov 2 act as a means of entry of viral RNA to the cell, through the ACE2 with which it interacts, continuing with the replication process. CTD-S has possible attachment sites near to the interaction zone with the ACE2, that it has change the structure of the protein and inhibits it function, becoming a target of studies with ligants of under molecular weight derived from medicinal plants, focusing drug desing of the treatment of COVID-19. In the present job a In Silico study was carried out of structural derivatives in extracted compounds of medicinal plants, that are related to respiratory disseases viral treatment, using them with possibles CTD-S ligants through of docking employing Autodock Vina software. Relatively high bond’s energies was found in amino acid’s near to the interaction zone, predicting the best complexes ligant-receptor and also validating them with the Fukui’s indices.