Predicción de las interacciones moleculares con el receptor NMDA de cuatro secuencias mutadas a partir de las secuencias de las Conantoquina G y T - modalidad Investigación

Abstract

Las enfermedades neurodegenerativas son un tipo de enfermedad que afectan directamente al sistema nervioso central en donde las células que lo constituyen mueren progresivamente; algunos ejemplos son el Alzheimer, Esclerosis múltiple y Parkinson. Estas neuropatologías pueden se causadas por un mal funcionamiento de los receptores NMDA (ácido N-metil-D-aspártato), el cual es el encargado de regular el potencial excitatorio. En la actualidad se conocen que el veneno de caracol conidae es una prometedora alternativa para la regulación del receptor NMDA. Por lo tanto, se seleccionó la conantokina G y conantokina T que a través de diferentes estudios se sabe que tiene cierta modulación en este receptor. Se generaron 5 mutaciones para la conantokina G y 5 mutaciones de la conantokina T de las cuales fueron seleccionadas 2 de cada una siendo ASMG1 y ASMG2 para la conantokina G y ASMT1 y ASMT2 para la conantokina T. se realizaron estudios in-silico para evaluación de los péptidos generados por medio de las plataformas Expasy, Pepcal, ThermoFicher para evaluación de variación de pesos moleculares y puntos isoeléctricos, ProtSclae y CellPPD para determinación de hidrofobicidad y además con el objetivo de evaluar las estructuras secundarias de los péptidos se realizaron análisis bajo la herramienta Ramachandran. Finalmente se realizó el acoplamiento molecular a través de la plataforma HADDOCK obtenido información de las interacciones presentadas y los residuos implicados con el receptor NMDA.

Neurodegenerative diseases are a type of disease that directly affect the central nervous system where the cells that constitute it die progressively; some examples are Alzheimer’s, multiple sclerosis, and Parkinson’s. These neuropathologies can be caused by a malfunction of NMDA receptors (N-methyl-D-aspartate acid), which is responsible for regulating the excitatory potential. Conidae snail venom is now known to be a promising alternative to NMDA receptor regulation. Therefore, conantokina G and conantokina T were selected, which through different studies is known to have some modulation in this receptor. 5 mutations were generated for conantokina G and 5 mutations of conantokina T were selected 2 of each being ASMG1 and ASMG2 for conantokina G and ASMT1 and ASMT2 for conantokina T. in-patient studies were performedsilico for evaluation of peptides generated by means of Expasy, Pepcal, ThermoFicher platforms for evaluation of variation of molecular weights and isoelectric points, ProtSclae and CellPPD for the determination of hydrophobicity and also with the aim of evaluating the secondary structures of the peptides were analyzed under the Ramachandran tool. Finally, molecular coupling was performed through the HADDOCK platform, obtaining information on the interactions presented and the residues involved with the NMDA receptor.