Show simple item record

dc.contributor.authorMalagón Bernal, Rafael Eduardospa
dc.contributor.authorFernández Navas, Manuel Alejandrospa
dc.contributor.authorAcevedo Sarmiento, Orlando Emiliospa
dc.date.accessioned2020-04-13T17:52:34Zspa
dc.date.available2020-04-13T17:52:34Zspa
dc.date.issued2012spa
dc.identifier.citationBernal, R. E. M., Navas, M. A. F., & Sarmiento, O. E. A. (2012). Theoretical molecular model of the G protein-coupled 5HT2A serotonergic receptor. [Modelo molecular teórico del receptor serotoninérgico 5HT2A acoplado a proteína G] Universitas Scientiarum, 17(2), 119-139.spa
dc.identifier.urihttps://revistas.javeriana.edu.co/index.php/scientarium/article/view/3687spa
dc.description.abstractTheoretical molecular model of the G protein-coupled 5HT2A serotonergic receptor. Objective Build a theoretical molecular model of the tertiary structure of the Homo sapiens 5HT2A receptor from experimentally obtained structures as templates. Materials and methods In the construction of the theoretical model we considered the protocol established by Ballesteros and Weinstein for the construction of the G-protein coupled receptor, by the alignment of the amino acid sequence, hydrophobicity profiles, refinement of loops by spatial restrictions and energy minimization with the force field OPLS_2005. Results The resulting model was validated by the Ramachandran plot with 91.7% of amino acids within the limits set for angles phi and psi and a RMSD of 0.95 Å with respect to bovine rhodopsin. Conclusions We obtained a validated theoretical model useful in studies of ligand-receptor docking.eng
dc.description.abstractModelo molecular teórico do receptor serotoninérgico 5-HT2A acoplado à proteína G. Objetivo. Construir um modelo molecular teórico da estrutura terciária do receptor 5HT2A de Homo Sapiens, com estruturas obtidas experimentalmente como moldes. Materiais e métodos. Para a elaboração do modelo teórico se utilizou o protocolo estabelecido por Ballesteros e Weinstein para a construção do receptor acoplado à proteína G, por intermédio de alinhamento da seqüência de aminoácidos, perfis de hidrofobicidade, refinamento de bucles por restrições espaciais e minimização da energia com o campo de força OPLS_2005. Resultados. O modelo obtido foi validado pelo gráfico de Ramachandran com 91,7% dos aminoácidos dentro dos limites estabelecidos para os ângulos phi e psi, e um RMSD de 0,95 Å com respeito à rodopsina de bovino. Conclusões. Obteve-se um modelo teórico validado, útil para a realização de estudos de acoplamento ligante-receptor.por
dc.description.abstractObjetivo. Construir un modelo molecular teórico de la estructura terciara del receptor 5HT2A de Homo sapiens a partir de estructuras obtenidas experimentalmente como plantillas. Materiales y métodos. Para la realización del modelo teórico se contempló el protocolo establecido por Ballesteros y Weinstein para la construcción del receptor acoplado proteína G, por medio de alineamiento de la secuencia de aminoácidos, perfiles de hidrofobicidad, refinamiento de bucles por restricciones espaciales, y minimización de energía con el campo de fuerza OPLS_2005. Resultados. El modelo obtenido fue validado por el gráfico de Ramachandran con un 91,7% de aminoácidos dentro de los límites establecidos para ángulos phi y psi, y un RMSD de 0,95 Å con respecto a rodopsina de bovino. Conclusiones. Se obtuvo un modelo teórico validado, útil para realización de estudios de acoplamiento ligando-receptor.spa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.language.isospaspa
dc.relation.ispartofseriesUniversitas Scientiarum;Vol. 17, No. 2, 2012, páginas 119-139spa
dc.rightsDerechos Reservados - Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientalesspa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/spa
dc.titleModelo molecular teórico del receptor serotoninérgico 5HT2A acoplado a proteína Gspa
dc.title.alternativeTheoretical molecular model of the G protein-coupled 5HT2A serotonergic receptoreng
dc.typeArtículo de revistaspa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.11144/javeriana.SC17-2.tmmospa
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0)spa
dc.subject.proposalReceptor proteína Gspa
dc.subject.proposalPerfil hidrofobicidadspa
dc.subject.proposalGráfico Ramachandranspa
dc.subject.proposalEnlace ortoestéricospa
dc.subject.proposalModelaje molecularspa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501spa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/articlespa
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersionspa
dc.subject.agrovocGénero humanospa
dc.subject.agrovocProteínasspa
dc.subject.agrovocAminoácidosspa
dc.subject.agrovocBovinaspa
dc.type.contentTextspa
dc.type.redcolhttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTspa
oaire.accessrightshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2spa
oaire.versionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85spa


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Derechos Reservados - Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales
Except where otherwise noted, this item's license is described as Derechos Reservados - Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales