Envíos recientes

Análisis bioinformático comparativo de la endolisina LysGH15 con otras endolisinas relacionadas

Corredor Chavarro, Laura | 2018-08

In the present project a comparative bioinformatic study of the endolysin LysGH15 encoded by bacteriophage GH15 and related endolysins used as an alternative in the treatment of bacterial infections resistant to antibiotics was carried out. The study was performed using bioinformatics tools such as GenBank used to obtain the amino acid sequence, to establish the biochemical parameters of the LysGH15 endolysin, the tool ProtParam of the ExPASy was used and, in regard to the structures of the endolysins, they were downloaded from Protein Data Bank .For the superposition of the structures the bioinformatic tool Raptor X was used. While, the multiple sequence alignment was performed with MAFFT. From the in silico comparison it was obtained that LysGH15 shows similarities in its sequence and catalytic residues (CYS54, HIS117 and ASP56) with LysK. While with the other endolysins only share some regions in their sequence and present variations in their structure

Análisis evolutivo de la adhesión: evidencia de selección positiva operante sobre el locus AlpAB Y el gen horB de Helicobacter pylori

Gutiérrez Escobar, Andrés Julián | 2015-07

La adherencia es un proceso clave para la infección por He-licobacter pylori, regulada por la expresión coordinada de adhesinas. Dentro de este grupo encontramos las proteínas AlpA/B y HorB que, recientemente, han llamado la atención de la comunidad científica, por su papel en el fitness de la bacteria. El objetivo del presente estudio fue describir la his-toria evolutiva de AlpA/B y HorB, desde un enfoque filogeo-gráfico. Para este fin, se descargaron secuencias específicas para AlpA, AlpB y HorB desde Uniprot y fueron analizadas en Muscle, Mega 5.1, PhyML 3.0.1, DNAsp 5.0 y PAML 4.5. En este estudio, se identificó que los genes alpA, alpB y horB siguen un modelo evolutivo de nacimiento y de muerte de genes, bajo selección purificadora. Además, se detectaron patrones de diferenciación genética significativos para alpA, entre las poblaciones de América-Europa (FsT 0,51395) y de Europa-Asia (FsT 0,46030) y para alpB, entre las pobla-ciones de América-Europa (FsT 0,43711), datos soportados por la prueba McDonald y Kreitman. Seguidamente, me-diante la herramienta PAML 4.5, se detectó que un 9,51% de la proteína AlpA, un 8,5% de la proteína AlpB y un 5% de la proteína HorBestán bajo selección positiva, determinando la presencia de linajes selectivos de H. pylori para zonas geo-gráficas específicas, que favorecen la adherencia al hospede-ro. Finalmente, se concluye que los genes codificantes para las adhesinas AlpAB y HorB tienen procesos de adaptación locales correlacionados con los orígenes filogeográficos de las cepas analizadas.

Coeficientes de digestibilidad aparente de Thitonia diversifolia y Cratylia argentea en cachama blanca y efectos sobre las vellosidades intestinales

Puerta Rico, Luis Fernando | 2017-07

In order to identify new sources of raw protein materials and not compete with human food, was the apparent digestibility coefficients of protein (CDA-P), dry matter (CDA-MS) and energy (CDA-E) of mexican sunflower (BO) Tithonia diversifolia and Cratylia (CR) Cratylia argentea, for cachama blanca Piaractus brachypomus and their effects on intestinal villi were determined. To estimate these coefficients, the indirect method with marker, feces collecting were employed. A hundred and twenty white cachamas (average weight 210g), fed on a diet reference semipurified (DRS) 69.5%, 0.5% inert trace marker ingredient and raw material were evaluated at a level of 30% inclusion. Feces were collected after 10 hours of food supply each hour during 12 hours. To measure the villi, intestine samples were taken at three times of diet consumption: 0, 5 and 10 days. The CDA-P were: 69.42% for Mexican sunflower and 44.84% for cratylia, being statistically differet. As for CDA E, Mexican sunflower 67.37% were higher and statistically different than cratylia 34.27%. Although digestibility values obtained for these raw materials were lower than those reported for raw materials most commonly used in fish feed, the Mexican sunflower approaches to soybean cake. Raw materials caused denudation in the villi during the first few days, however after 10 days the villi started to recuperate its high, showing an adaption of P. brachypomus to the evaluated ingredients.

Combretastatin A-4 induces p53 mitochondrial-relocalisation independent-apoptosis in non-small lung cancer cells

Méndez Callejas, Gina Marcela | 2014

CombretastatinA-4(CA-4)isoneofthemosteffectiveagentsusedinchemotherapy.Nevertheless,thecontributionofp53and Bim proteins in the CA-4-induced apoptosis in non-small lung cancer cells (NSCLC) remains unresolved, specifically on involving of p53 in the mitochondrial pathway activation by a transcription-independent mechanism. In this context, the p53null H1299 and wt-p53 H460 NSCLC cells, in the absence and presence of pifithrin-m (PFTm), an inhibitor of p53 mitochondrial-translocation, were treated with CA-4 and different cellular endpoints were analysed. In contrast to previous observationsinH460cells,CA-4failedintheactivationofanapoptoticresponseinH1299cells,thusindicatinganinvolvement of p53 in the cell death induced by the drug. We found that CA-4 led to p53 cellular re-localisation in H460 cells; in particular, p53 was released from the microtubular network and accumulated at mitochondria where it interacts with Bim protein and other proteins of the Bcl-2 (B-cell leukaemia-2) family, leading to cytochrome c release, alteration in the mitochondrial membrane polarisation, cell cycle arrest at the G2/M-phase, and cell death. Interestingly, the cytosolic and the mitochondrial accumulation of protein Bim was strictly dependent on p53 status. The extent of cell death was not reduced in H460 after combinedtreatmentofPFTmwithCA-4.Overall,thedatasupportamodelofCA-4-inducedapoptosisinNSCLC,forwhichthe expression of p53 protein is essential, but its mitochondrial function, linked to p53-transcription independent apoptosis pathway, is negligible.

Efecto de la suplementación sobre la ganancia de peso y rendimiento en canal de corderos sudan

Maza Angulo, Libardo | 2015-01

Evaluación de dietas isoenergéticas con varios niveles de proteína y de harina de pescado en alevinos de bocachico (Prochilodus magdalenae)

González Uribe, René Adolfo | 2009-07

To measure the effect of three protein levels (24, 28 and 32%) with and without the incorporation of fishmeal HP (7.5 and 0%), isoenergy diets (3100 Kcal / kg), with similar amounts of five essential amino acids (lysine, methionine + cystine, threonine and tryptophan) in the performance of bocachico (Prochilodus magdalenae) fries, in an experiment of 32 days was performed. For this purpose a completely randomized design with a factorial arrangement 3 * 2 (three levels of protein and two levels of HP) due to a difference in initial weights and standard lengths was employed. An ANACOVA, to assess the effect of the six diets in the final weight, weight gain expressed as percentage, specific growth rate and gain in standard length was executed. Finally, it was concluded that no significant difference (P> 0.05) among the different diets on these parameters was detected, so it can be stated that bocachico fries well tolerated diets devoid of fish meal as long as they have with a good balance of amino acids; furthermore, they can show also a good performance with diets with protein content of 24%.

Evaluación de la calidad de la carne de camuro y su aplicación a nivel industrial

Conde Pulgarín, Abelardo | 2003-09

Se realizaron varios experimentos en la universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales UDCA, para evaluar la calidad de la carne de ovino africano. Primero se determinó la calidad relacionada con la composición proximal medida como agua, proteína, grasa, ceniza y pH determinados en tres cortes comerciales, pierna, lomo y brazo en 20 canales distribuidos en cuatro grupos: jóvenes menores de 18 meses de edad: adultos mayores de 18 meses de edad y por sexo machos enteros y hembras. Segundo, la calidad nutricional relacionada con la composición de lípidos: ácidos grasos saturados e insaturados. Tercero: se evalúo la calidad tecnológica: Los valores de la composición fueron utilizados para diseñar productos procesados tipo emulsión, correspondientes a cinco tratamientos con diferentes relaciones agua: proteína. Por ultimo se evalúo la calidad sensorial: se utilizó carne y grasa de oveja Africana como materia prima y se comparó con la carne de ovinos de lana, cerdo y sus grasas. Las cantidades de agua y ceniza no presentaron diferencias significativas, entre sexos, edades y cortes comerciales (p>0,05). Los valores de proteína estuvieron entre 17,2% - 23,5% y no presentan diferencias significativas (p>0,05). La grasa intramuscular, menor del 10%, clasificó esta carne como carne magra y no mostró diferencia significativa entre sexos, edad y cortes comerciales (p>0,05). La grasa de camuro mostró un perfil de ácidos grasos más saturado que la grasa de res y cerdo. Todos los tratamientos tipo emulsión con relaciones agua: proteína hasta 1:6 fueron estables y no perdieron peso durante el procesamiento. Estos ensayos y los paneles de calidad sensorial demostraron que la carne de ovino africano es buena como materia prima, pero su grasa genera algunos problemas de sabor y formación de grumos en la mezcla, debido a la alta saturación de sus ácidos grasos. Para elaborar emulsiones cárnicas fue necesario reemplazar la grasa de camuro por grasa de cerdo.

Evaluación de las propiedades reológicas de pastas de ajonjolí artesanal y tecnificada

Acevedo, Diofanor | 2013-01

Las pastas de ajonjolí son una suspensión coloidal com-puesta, principalmente, de sólidos hidrófilos suspendidos en aceite. En este trabajo, se elaboraron dos tipos de pastas de ajonjolí: una por el método artesanal y la otra mediante una técnica tecnificada; posteriormente, se le realizaron análisis proximales y se determinaron los efectos de los procesos de elaboración en el comportamiento reológico y la estabilidad. El perfil de viscosidad obtenido para las pastas indicó un comportamiento pseudoplástixco. La sinéresis de la pasta elaborada artesanalmente fue mayor, siendo de 40%, mien-tras que para la pasta tecnificada fue de 15%, razón por la cual, fue más estable. Por lo que se concluye, que el proceso tecnificado es más eficiente y recomendable para la elabora-ción de este tipo de productos.

Evaluating the immunogenicity of chemically-synthesised peptides derived from foot-and-mouth disease VP1, VP2 and VP3 proteins as vaccine candidates

Avendaño, Catalina | 2020

Foot-and-mouth disease (FMD) is one of the most contagious veterinary viral diseases known, having economic, social and potentially devastating environmental impacts. The vaccines currently being marketed/sold around the world for disease control and prevention in bovines do not stimulate the production of antibodies having crossed reactions to different serotypes. This means that if an animal becomes infected by a serotype which has not been included in a vaccine then it will develop the disease. Synthetic peptide vaccines represent a safer option and (depending on the design) can stimulate antibodies protecting against different variants. Based on the forgoing, this work was aimed at evaluating FMDV VP1, VP2 and VP3 protein-derived, modified and chemically-synthesised peptides’ ability to induce an immune response for developing a vaccine contributing towards controlling the disease. VP1, VP2 and VP3 proteins’ conserved regions were selected for this. Peptides from these regions were chemically synthesised; binding assays were then carried out for ascertaining whether they were involved in BHK-21 cell binding. Selected peptides’ structure and location were studied. Peptides which did bind were modified and formulated with Montanide ISA 70 adjuvant; 17 animals were immunised twice with the formulation. The animals were genotyped by amplifying the BoLA-DRB3.2 gene. Blood samples were taken from 17 cattle on day 43 post-first immunisation for studying the formulation's immunogenicity. The sera were used in ELISA, immunofluorescence, flow cytometry, immunoadsorption and seroneutralisation assays. The A24 Cruzeiro and O1 Campos virus serotypes were used for these assays. The results revealed that even though protein exposure and 3D structure might be different amongst serotypes, the antibodies so produced could inhibit virus entry to cells, thereby showing the selected peptides’ in vitro protection-inducing ability.

Gene and protein expression of myosin heavy chain in Nellore cattle comparing growth or meat tenderness traits

Chardulo, Luís Artur Loyola | 2019

The objective was to investigate gene and protein expression of myosin heavy chain (MyHC) in Nellore cattle slaughtered at different weights (BW) or degrees of meat tenderness. Ninety animals with initial BW 370 ± 37 kg, 24 months of age, were slaughtered after 95 days on feed. We evaluated shear force (SF), myofibrillar fragmentation index, ribeye area, backfat thickness, marbling, color, and cooking losses. Subsequently, 24 animals were selected and divided into four contrasting groups, in which light (BW ¼ 504.58 ± 32.36 kg) versus heavy animals (BW ¼ 604.83 ± 42.97 kg) and animals with tender (SF ¼ 3.88 ± 0.57 kg) versus tough meat (SF¼ 7.95 ± 1.04 kg) were compared. The MYH7, MYH2 and MYH1 genes were analyzed by real-time PCR. The MyHC isoforms (MyHC-I, MyHC-IIa, and MyHC-IIx) were quantified by SDS-PAGE electrophoresis. We found lower expression of MYH2 and MYH1 genes in heavy compared to light animals and a higher amount of MyHC-I isoform in the tough meat group compared to the tender meat group. Protein expression of MyHC-IIa was higher in the tender meat group. A negative correlation was found of this protein and SF (tenderness), suggesting MyHC-IIa as a biomarker of meat quality.

Intestinal changes and performance parameters in ticks feeding on calves immunized with subunits of immunogens against Rhipicephalus microplus

Tafur Gómez, Gabriel A. | 2020

We describe the intestinal changes and biological parameters of the tick species Rhipicephalus microplus exposed to the immune response of calves vaccinated with two subunits of immunogens. The first group of Bos taurus calves was immunized with a synthetic peptide (SBm7462), whereas the second group received an inoculum for synthetic control. The third group was immunized with a recombinant peptide (rSBm7462); an inoculum was injected into a fourth group of calves for recombinant control. Each formulation was administered to these calves during three times at intervals of 30 days. At 21 days after the last immunization, the calves were challenged using a total of 4500 larvae per animal. Indirect ELISA was realized to identify the kinetics of IgGs from samples of calves studied. Naturally detaching ticks were collected for analyses of biological performance and histological changes in the midgut. We dissected randomly detached ticks. The midgut of each of these ticks was removed and processed routinely for histology, stained with hematoxylin-eosin (H&E) and slow Giemsa. Slides were also subjected to immunohistochemistry. The antibody response showed significant induction of high-affinity IgGs in calves immunized with both peptides in comparison to calves of the control groups. Histological changes included damage of the intestinal epithelium in ticks fed on immunized hosts and intense immunostaining in midgut cells, using the serum of calves immunized with recombinant peptide. There were significant differences in all biological performing parameters of ticks detached from vaccinated calves in comparison with ticks of the control groups. We identified reductions of 87.7 and 93.5% in engorged ticks detached from calves immunized with a synthetic and recombinant peptides, respectively, a 28 and 8.60% lower egg mass in groups immunized with synthetic and recombinant peptides, respectively, and a 38.4% reduction of the value of nutrient index/tick in the group immunized with the recombinant peptide. Our findings show that the immune response induced by small peptides in cattle can modify the digestion and metabolism of ticks fed on vaccinated animals, resulting in changes in tick performance.

Modelo molecular teórico del receptor serotoninérgico 5HT2A acoplado a proteína G

Malagón Bernal, Rafael Eduardo | 2012

Theoretical molecular model of the G protein-coupled 5HT2A serotonergic receptor. Objective Build a theoretical molecular model of the tertiary structure of the Homo sapiens 5HT2A receptor from experimentally obtained structures as templates. Materials and methods In the construction of the theoretical model we considered the protocol established by Ballesteros and Weinstein for the construction of the G-protein coupled receptor, by the alignment of the amino acid sequence, hydrophobicity profiles, refinement of loops by spatial restrictions and energy minimization with the force field OPLS_2005. Results The resulting model was validated by the Ramachandran plot with 91.7% of amino acids within the limits set for angles phi and psi and a RMSD of 0.95 Å with respect to bovine rhodopsin. Conclusions We obtained a validated theoretical model useful in studies of ligand-receptor docking.

Parámetros fisicoquímicos, microbiológicos y sensoriales de salchichas elaboradas con inclusión de quitosano

Hleap, José Igor | 2015-07

Las industrias cárnica y pesquera están buscando constante-mente ingredientes, como alternativas seguras para aumen-tar las características de sabor y de color de los productos finales, sin afectar las propiedades sensoriales, nutricionales y funcionales. En este estudio, se evaluó el quitosano, como un elemento extensor en embutidos de carne y de pescado. Se elaboraron cuatro tipos de embutidos: dos, a base de carne de cerdo y dos, de filete de tilapia. Cada grupo, se dividió en dos subgrupos. En el primer subgrupo, se añadió harina de trigo, como único componente (100% de harina de trigo), mientras que en el otro, se añadieron 35% quitosano y 65% de harina de trigo. Se sometieron a análisis micro-biológicos, fisicoquímicos y sensoriales; el análisis sensorial fue realizado por un grupo de 77 panelistas no entrenados, utilizando una escala hedónica de siete puntos, estudiando el sabor, el color, el olor, la textura y la opinión general; to-das las características fueron aceptables, excepto el color. Los parámetros fisicoquímicos no mostraron diferencias estadísticamente significativas dentro de cada subgrupo de salchichas; sin embargo, la comparación entre los dos gru-pos, mostró diferencias significativas (p<0,05) en el conte-nido de proteína y de grasa. Para las salchichas de carne de cerdo, más del 50% de los panelistas juzgaron positivamente sobre los parámetros sensoriales. A partir de los productos elaborados, las salchichas de carne de cerdo tuvieron mejor aceptación organoléptica, para las de filete de pescado no fue así, probablemente, debido a la falta de conocimiento de este producto no tradicional.

Physical and compositional characteristics of cheese and yogurt made from partially demineralized milk protein concentrate

Bejarano Toro, Edinson | 2021

El uso de concentrados de proteína de leche (MPC) ha sido estudiado ampliamente; sin embargo, su desmineralización parcial por medio de la diafiltración (DF) y el efecto de este tratamiento sobre su aptitud en la elaboración de productos coagulados no está completamente explorada. Se planteó, entonces, estudiar el proceso de desmineralización de un MPC por medio de varios ciclos de DF y evaluar el efecto de este tratamiento sobre las características composicionales y texturales de productos coagulados enzimáticamente y por acidez. El MPC, obtenido por ultrafiltración, fue diafiltrado en dos ciclos; luego, el MPC fue usado para elaborar un queso fresco, un yogurt batido y uno cuchareable. La aplicación de un ciclo de DF removió el 22,2% de las cenizas y 8,12% del calcio, pero no hubo diferencias significativas (P>0,05) con respecto a la aplicación de dos ciclos de DF. El queso elaborado con el MPC, con uno y dos ciclos de DF, fue menos duro y presentó menor resistencia a la masticación que el elaborado con MPC sin DF y el yogurt cuchareable presentó menor elasticidad, debido al menor contenido de sólidos totales y calcio, los cuales, fueron afectados por la DF. La desmineralización parcial aumentó el tiempo de coagulación y favoreció la formación de geles más débiles. La DF alcanzó el máximo de desmineralización de la leche en un solo ciclo.

Relación proteína/energía digestible para alevinos de bocachico (prochilodus magdalenae). Steindachner, 1878

González Uribe, René Adolfo | 2005-07

Para determinar la relación adecuada de Proteína Cruda (PC)/Energía Digestible Calculada (EDC) en la dieta para alevinos de bocachico (Prochilodus magdalenae), se diseñó un experimento en 24 acuarios, con una duración de 60 días, realizado en el laboratorio de Nutrición de Peces de la Facultad de Medicina Veterinaria y de Zootecnia de la Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá. Debido a la sensibilidad por manipulación de los animales, solamente se realizaron mediciones a los 0, 30 y 60 días. El alimento se ofrecía tres veces al día (8:00 am, 12:00 m y 4:00 pm), teniendo en cuenta el 15% de la biomasa de los alevinos depositados en cada acuario. Diariamente, se llevó a cabo un recambio de agua de cada acuario correspondiente al 15% y cada semana se realizaba un lavado de filtros y un recambio del 80%. Se elaboraron seis dietas experimentales, en donde se evaluaron dos niveles de PC (34 y 36%) y tres niveles de EDC (3000, 3100 y 3200 kilocalorías/ kilogramo (kcal/kg)). Las variables evaluadas fueron ganancia de peso expresado como porcentaje, tasa de crecimiento específico, longitud estándar y conversión alimentaria. La mayor ganancia de peso expresado como porcentaje y la mayor tasa de crecimiento específico, se presentaron con la dieta que contenía 36% de proteína cruda y 31 OOkcal/kg de EDC, correspondiendo a 116,12 mg PC/kcal. Las demás variables no presentaron diferencias significativas (P<0,05).

Revisión monográfica de la obtención de péptidos mediante varios métodos, empleando elementos naturales, visión general en el mundo y Colombia

Marulanda Guzman, Monica Andrea | 2015

Entre los elementos más destacados, se encuentran los péptidos y sus diferentesaplicaciones en productos de consumo humano, animal. Históricamente desde el año1901 aproximadamente, con el aislamiento de la prolina y valina, se encontró que laproducción, aislamiento, hidrólisis y síntesis de péptidos en el mundo, comenzaba aganar importancia, el primer péptido de gran valor la oxitocina, cuyo uso es clínico, se muestra en la historia, avances y usos de estos elementos al respecto. Los péptidos se obtienen por diferentes métodos, como procesos de síntesis química,hidrólisis y aislamiento; se pueden elaborar a partir de elementos naturales propios del ecosistema local. Por ejemplo, el uso de hidrolizados de proteínas, obtenidos a partir de material como: soya, trigo, arroz, pescado y algas, los cuales conceden propiedades adicionales como solubilidad, capacidad espumante, en dietas enterales y alimentos infantiles. Cosméticos con propionato retinilo para mejorar la apariencia de la piel, disminución de líneas de expresión, mejorando notablemente el aspecto y tolerancia al producto. Siendo Colombia, el segundo país del mundo con mayor cantidad de especies animales y vegetales, después de Brasil, se busca orientar con teoría, trabajos que se han realizado alrededor del mundo con obtención y aislamiento de péptidos a partir de este origen, avances en el país, obteniendo un documento que consolide la información, de manera crítica – descriptiva, disponible al lector.

Structural features of the two-component system LisR/LisK suggests multiple responses for the adaptation and survival of Listeria monocytogenes

Arenas, Nelson E. | 2013

Here, we characterized the structure of the two-component regulatory system, LisR/LisK, in Listeria monocytogenes. To predict the structure of both proteins and the relationship between them, we employed several bioinformatic tools and databases. Based on our results, LisK protein is embedded in the cell membrane and its modular composition (HAMP, histidine kinase and ATPase domains) is associated with its autophosphorylation (His-266). A stimulus-response likely determines the sequential signal propagation from the bacterial cell surface to its cytoplasmic components. According to our results, LisR is a cytoplasmic protein with a receptor domain (homologous to CheY) that comprises a phosphoacceptor residue (Asp-52) and a DNA-binding domain, which may allow the transmission of a specific transcriptional response. LisR/LisK has been experimentally characterized both biochemically and functionally in other Bacilli pathophysiology; our structure-function approach may facilitate the design of suitable inhibitors.

Uso de aislado de soya como sustituto de grasa en la elaboración de hamburguesas de carne de conejo

Martínez Otalora, Andrea Mayerly | 2020-05

La manera en la que el ser humano se ha alimentado a lo largo de los años ha evolucionado, a los primeros homínidos se les denominó cazadores y recolectores, es decir consumían proteína de origen animal y proteína de origen vegetal; lo que empezó a diferenciar el consumo de alimentos entre el humano y el animal era la cocción de los alimentos, el poder cocinar los alimentos amplió las opciones de consumo de los mismos. Con la llegada de la agricultura, la ganadería, las divisiones socioeconómicas y religiosas la alimentación del ser humano empezó a variar según las culturas creadas en todo el mundo y su poder adquisitivo. Con esto llegó la malnutrición energético-proteica, por la necesidad de conseguir alimentos de manera rápida, lo que en otros casos genera la sobre alimentación y llegan los problemas de obesidad, para contrarrestar los problemas de obesidad se recomendó no consumir en exceso alcohol, papas, legumbres, harinas, comidas excesivamente grasas etcétera (etc) y con esto llegó un concepto llamado “el culto al cuerpo” que consiste en el cuidado corporal con una alimentación sana, es decir el manejo de una dieta basada en el bajo consumo de calorías. (Bernabeu, Esplugues, & Trescastro, 2014