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Estudio computacional del acoplamiento molecular de la proteína P-53 con el flavonoide CT-1

Mahecha Moreno, Ingrith Zulay (Universidad de Ciencias Aplicadas y AmbientalesFacultad de CienciasBogotá, 2022)

El cáncer es una enfermedad que resulta de la interacción de un agente que lo causa y la reacción del organismo vivo; resulta crónica, pero es evitable y curable en un gran número de casos. Las teorías modernas de la ...
Estudio computacional del acoplamiento molecular de XIAP-BIR3 con ligantes de núcleo estructural alquílfenol

Valencia Rodríguez, Catherine (Facultad de CienciasQuímica, 2018)

X-Linked Inhibitor of Apoptosis Protein (XIAP) acts as a cellular apoptosis inhibitor due to its high selectivity to caspase 9. This caspase activates caspases 3 and 7 in an autocatalytic way to produce cellular death. ...
Estudio del acoplamiento molecular en el dominio BIR3 de la proteína XIAP con algunos flavonoides aislados de Chromolaena tacotana

Roso Bernal, Michael Yesid (Universidad de Ciencias Aplicadas y ambientalesFacultad de CienciasBogotá, 2022)

El inhibidor de la proteína de apoptosis ligado al cromosoma X (XIAP) es un miembro de la familia de las proteínas inhibidoras de apoptosis (IAPs) responsable de neutralizar el efecto de las caspasas 3, 7 y 9. La sobreexpresión ...
Predicción de la actividad de la toxina Tma1 del veneno de escorpión Tityus macrochirus sobre canales iónicos de sodio presentes en las células cancerosas de cuello uterino

Chaves Vargas, Juanita (Universidad de Ciencias Aplicadas y AmbientalesFacultad de CienciasBogotá, 2022)

Uno de los canceres más comunes a nivel mundial entre las mujeres es el cáncer de cuello uterino, la mayoría de los casos se pueden prevenir mediante exámenes de detección de rutina y con el tratamiento de lesiones ...

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Estudio computacional del acoplamiento molecular de la proteína P-53 con el flavonoide CT-1
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Mahecha Moreno, Ingrith Zulay | 2022

El cáncer es una enfermedad que resulta de la interacción de un agente que lo causa y la reacción del organismo vivo; resulta crónica, pero es evitable y curable en un gran número de casos. Las teorías modernas de la carcinogénesis explican que se da por factores exógenos como agentes químicos, agentes físicos y agentes biológicos, también hay factores endógenos como el factor hereditario, el factor inmunitario, factor hormonal y factores nutritivos (Varela, 2002). Según la OMS el Cáncer es una de la segunda causa de muerte a nivel mundial, OMS (Organización Mundial de la Salud), sept. 2021), por esto ha venido siendo un campo muy estudiado, minimizando así dichos casos y convirtiéndolo en una enfermedad a la que se puede sobrevivir y otro porcentaje recuperarse en su totalidad. La funcionalidad de la proteína p-53 es principalmente un factor de transcripción y puede generar una variedad de programas anti-proliferativos al activar o reprimir genes efectores. El desarrollo de nuevos fármacos ha abierto paso a combinar la proteína p-53 con flavonoides, para potencializar su efecto anti-proliferativo. Las mutaciones en el gen p53 contribuyen aproximadamente la mitad de los casos de cáncer humano, ocurre cuándo se cambian la información del ADN en una posición y hacen que la célula construya p53 con un error, intercambiando un aminoácido incorrecto en un punto de la cadena de proteínas. En estos mutantes, la función normal de p53 está bloqueada y la proteína no puede detener la multiplicación en la célula dañada. (Goodsell, 2002). Los flavonoides pueden interferir en la carcinogénesis participando en el bloqueo o la supresión de diversos procesos, los efectos que se le atribuyen a los flavonoides son la capacidad de capturar radicales libres, así como la modificación de enzimas que desintoxican carcinógenos. El CT1 es un flavonoide con fórmula 3, 5, 4’- trihidroxi – 7 – metoxiflavona extraído a partir de la especie Chromolaena tacotana. En el presente trabajo se estudiaron las características del flavonoide CT-1 y de la proteína p-53, se reconocieron las interacciones moleculares del acoplamiento entre el p-53 y el flavonoide CT1, comparando dichas interacciones con el acoplamiento del flavonoide Quercetina y p-53.

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Estudio computacional del acoplamiento molecular de XIAP-BIR3 con ligantes de núcleo estructural alquílfenol
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Valencia Rodríguez, Catherine | 2018

X-Linked Inhibitor of Apoptosis Protein (XIAP) acts as a cellular apoptosis inhibitor due to its high selectivity to caspase 9. This caspase activates caspases 3 and 7 in an autocatalytic way to produce cellular death. Alanine-Valine-Proline-Isoleucine (AVPI) join XIAPBaculovirus Inhibitor of apoptosis (BIR3) protein Repeat to inhibit selectivity to caspase 9. Recent studies evidence embelin as a powerful XIAP inhibitor. Embelin is a target in the study of low molecular mass ligands extracted from natural products, which has been used in traditional medicine. Embelin also is used as a reference compound in anti-cancer pharmaceutical products design. In this work, ligands extracted from Pipper gibbilimbum and Anarcadium occidentale were studied using molecular docking, with the autodock4.2 software package. The a nity between all the studied ligands and the BIR3 domain's active site BIR3 in XIAP was found. Also, was found that interactions in studied complexes have coincidence between 90 and 100% with interactions embelin-XIAP-BIR3. Using binding free energy and inhibition constants, better ligand-receptor complexes were predicted.

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Estudio del acoplamiento molecular en el dominio BIR3 de la proteína XIAP con algunos flavonoides aislados de Chromolaena tacotana
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Roso Bernal, Michael Yesid | 2022

El inhibidor de la proteína de apoptosis ligado al cromosoma X (XIAP) es un miembro de la familia de las proteínas inhibidoras de apoptosis (IAPs) responsable de neutralizar el efecto de las caspasas 3, 7 y 9. La sobreexpresión de esta proteína disminuye el proceso de apoptosis en la célula y es uno de los factores principales que promueven el desarrollo del cáncer. En este trabajo, se determinaron por medio de ensayos in silico de acoplamiento molecular y dinámica molecular, las interacciones de algunos flavonoides obtenidos de la planta Chromolaena tacotana con el dominio BIR3 de la proteína XIAP. Además, se evaluó la actividad citotóxica del compuesto (S)-2-hidroxi-2-(4-hidroxibencil)-4,6-dimetoxibenzofuran-3(2H)-ona en líneas celulares de cáncer de mama MCF7 y MDAMB231, obteniendo valores de IC50 de 64,7 µg/mL y 40,6 µg/mL respectivamente

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Predicción de la actividad de la toxina Tma1 del veneno de escorpión Tityus macrochirus sobre canales iónicos de sodio presentes en las células cancerosas de cuello uterino
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Chaves Vargas, Juanita | 2022

Uno de los canceres más comunes a nivel mundial entre las mujeres es el cáncer de cuello uterino, la mayoría de los casos se pueden prevenir mediante exámenes de detección de rutina y con el tratamiento de lesiones precancerosas. Como resultado, la mayoría de los casos de cáncer de cuello uterino se diagnostican en mujeres que viven en regiones con protocolos de detección inadecuados. Debido a esto, este proyecto pretende desarrollar de manera in silico una nueva elección de tratamiento, por medio del estudio de la toxina Tma1 que se encuentra en el veneno de escorpión Tityus macrochirus, con lo cual, ejerce su función sobre canales de sodio presentes en el cáncer de cuello uterino. Se emplearon herramientas bioinformáticas, mediante las cuales se logró predecir la estructura secundaria, dicha estructura que está compuesta por hojas plegada beta y estructuras Ramdon Coil y se predijo un modelo tridimensional empleando SwissModel, el cual es favorable de acuerdo a la evaluación realizada con GMQE (Estimación de la calidad del modelo global) = 0,80; QMEANDisCo = 0,75; puntuación de MolProbity = 1,30; favorabilidad de Ramachandran = 95,0. Luego se realizó el Docking molecular con HADDOCK 2.4, entre el péptido Tma1 y el canal de sodio Nav1.6, en cuyos resultados se seleccionó el grupo 8 por su mejor puntuación en HADDOCK. Las interacciones fueron evaluadas por Biovia Discovery Studio, obteniendo interacciones en su mayoría de tipo convencionales con un 24,1% de ellas, dichas interacciones que se presentaron son favorables para que se pueda dar una inhibición de la subunidad Nav 1.6 del canal de sodio dependiente de voltaje por parte de la toxina Tma1 del escorpión T. macrochirus

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