Envíos recientes

Association of complement C3d receptor 2 genotypes with the acquisition of HIV infection in a trial of recombinant glycoprotein 120 vaccine

Meza Barreto, Giovanna | 2020

Objectives:Complement C3d receptor 2 (CR2) is the main receptor for complement protein C3d and plays an important role in adaptive immune responses. CR2 genetic variants are associated with susceptibility to systemic lupus erythematosus as well as to HIV-1 infection. In addition, CR2 function can be subverted by HIV-1 for an efficient entry into target cells; in a process known as antibody-dependent enhancement of viral infection. We sought to determine the association between CR2 gene variants with HIV-1 acquisition after vaccination with recombinant gp120 protein (Vax004 clinical trial).Design and methods:This is a retrospective cross-sectional study, comprising male volunteers of European ancestry including infected (n=273) and uninfected (n=402) vaccinees and placebo, who were genotyped for three single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the CR2 gene region.Results:An interaction was observed between the baseline sexual behavior and the SNP rs3813946 for higher risk of infection in vacinees (interaction term P=0.02). This SNP was associated with increased susceptibility to HIV-1 infection after vaccination in volunteers with low behavioral risk odds ratio (95% confidence interval): 5.5 (1.4-21.7) P=0.006 but not vaccinees with high behavioral risk or volunteers given placebo (P=0.7). Moreover, CR2 genotype was strongly associated with the rate of HIV-1 acquisition after vaccination in low-risk volunteers [hazard odds ratio (95% confidence interval): 3.3 (1.6-7.0), P=0.001].Conclusion:The current study suggests that CR2 may play a role in HIV-1 acquisition after vaccination with rgp120 proteins.

Determinación de interleuquina seis (il-6) y proteína c reactiva (pcr) en pacientes con Inflamación renal

Meza Barreto, Giovanna | 1999-07

Inflammation is the first defense mechanism mastered by live tissues tacing a physical,Chemical or biological aggression. Within these the inmunocomplexes are found, which in a given moment can be the direct responsibles of the infiammatory response activation at renal level, mainly glomerular, with commitment of the cellular and humoral immunity. This process is mediated by proinflammatory cytokines as interlenkin - 6 IL - 8, IL - 1, factor of necrosis tumoral alpha (TNF alpha) and acute phase proteins like C-reactive protein (PCR), a-seric Amiloide and fibrinogen. In order to know the role of the two proteins in the mentioned pathology, the levels of IL-6 and PCR in serum and uriñe samples of patients with inflammation renal were determined. Furthermore their relationship was studied, since IL-6 acts on the hepatocyte inducing the production of acute phase proteins. The results showed a no significant difference between the IL-6 urinary valúes of the study and the control group. In 55% of the patients the serum PCR valúes were higher than 6 mg/l while in the rest, it was lower. The uriñe sample of one patient presented a significant concentration of this protein, important finding since PCR han not been determined in uriñe before. No direct realtionship between the IL-6 and PCR leves was detected in the analyzed samples.

Documentación para la Gestión y Manejo de Reactivos en el Laboratorio de Investigación y Diagnóstico Molecular BSL-3 de la Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales (U.D.C.A) bajo la NTC- ISO/IEC 17025:2017

Daza Garzón, Nathaly Alejandra | 2021

En la presente tesis se recopiló todo el marco teórico relacionado con las normativas nacionales e internacionales en vigencia para el manejo de reactivos que se utilizan en los laboratorios de ensayo, en este caso reactivos químicos, materiales de referencia, reactivos usados solo en investigación y reactivos de diagnóstico in vitro que se utilizarán en el Laboratorio de Investigación y Diagnóstico Molecular BSL-3 para la realización de la técnica analítica RTqPCR para diagnóstico del COVID-19. Apartir de la información obtenida y la dispuesta por los fabricantes de los kits comerciales, se seleccionó la información necesaria que debía contener la documentación correspondiente a la gestión y manejo de los reactivos; se elaboraron: 1 manual, 4 procedimientos generales para la recepción, manipulación, etiquetado, almacenamiento, manejo de derrames y disposición final de residuos peligrosos, 21 formatos, 19 POE’s por cada reactivo/ grupo de reactivos y 36 fichas de datos de seguridad por reactivo/ Kit bajo la NTC- ISO/IEC 17025:2017, las cuales proporcionan el conocimiento para una actuación rápida y correcta ante un evento o incidente. Los POE’s obtenidos favorecen el desarrollo de las actividades del laboratorio de forma secuenciada facilitando el manejo de los reactivos; así como también los procedimientos generales estandarizan las operaciones, los formatos permiten tener una trazabilidad acerca del manejo de los reactivos y el manejo de las fichas de datos de seguridad permiten una acción rápida y correcta ante un evento o incidente.

Evaluación preliminar de dos métodos para el diagnóstico de la anemia infecciosa equina por la técnica de reacción en cadena de la polimerasa

Meza Barreto, Giovanna | 2003-09

La Anemia Infecciosa Equina (AlE), el “sida" de los caballos es una enfermedad infectocontaaiosa causada por un Lentivirus de la familia Retroviridae. Se diagnostica en Colombia mediante pruebas serológicas tales como inmunodifusión (Coggins) y ELISA técnicas que eventualmente pueden arrojar resultados falsos positivos y falsos negativos, razón por la cual se crea la necesidad de estandarizar una prueba de Biología Molecular, como la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) que permita detectar la presencia o ausencia del virus en los animales. En el presente trabajo se evaluaron dos metodologías de PCR para la estandarización de dicha técnica, con fines de diagnóstico de la Anemia Infecciosa Equina. El método uno consistió en una técnica sencilla de PCR cuyos iniciadores “Primer A" (PA) y “Primer B" (PB) flanquean una región de 510 pares de bases (pb) correspondiente al gen gag del Virus de la Anemia Infecciosa Equina (VAIE). El método dos contempló la técnica de PCR anidada con los iniciadores externos “Primer E” (PE) y “Primer F” (PF) que flanquean una región de 780 pb; los “Primers C” (PC) y “Primers D” (PD), como iniciadores internos que flanquean una región de 410 pb del gen gag del VAIE. Los resultados mostraron que el método uno permite amplificar segmentos compatibles con el gen gag del VAIE, pero solo en las muestras controles positivos y no en las muestras del banco de ADN provenientes de animales serológicamente positivos al VAIE. El método dos permitió amplificar segmentos de aproximadamente 800 y 400 pb del gen gag del VAIE, tanto en las muestras controles positivos como en las muestras seropositivas del banco de ADN, indicando mayor sensibilidad que el método uno; sin embargo se presentaron bandas de carácter inespecífico de peso molecular de 300pb aproximadamente. Para la detección de| provirus AIE en muestras de sangre de equinos asintomáticos, se recomienda emplear la modalidad de PCR anidada.

Evaluación preliminar de la anemia infecciosa equina, forma sintomática y asintomática en caballos criollos en Colombia

Meza Barreto, Giovanna | 2006-01

Con los 1669 brotes de Anemia Infecciosa Equina (AIE) en el año 2003 y la observación de 3354 casos, la industria equina colombiana se ve seriamente afectada. Estudios previos de AIE en caballos criollos, han indicado que la forma de presentación de la enfermedad difiere con lo reportado en la literatura internacional, haciéndose necesario la elaboración de una encuesta dirigida a médicos veterinarios, para conocer la proporción de caballos criollos seropositivos que en los últimos cinco años han presentado la forma sintomática, asintomática y aquellos muertos por AIE. Los resultados muestran que en la zona caribe la mortalidad fue del 1,30%, en la región pacífica del 6,06%, en la zona sur del 12,77% y en la zona centro del 10,28%. En el caribe, la forma sintomática se presentó en un 85% y la asintomática en un 12,98%, mientras que en la zona centro estos porcentajes correspondieron a 22,89% y 66,82%. El 63,64% y el 37,23% manifestaron signos clínicos en las zonas pacífica y sur, respectivamente. La población registrada como portador asintomático en el pacífico fue de 30,3% y en el sur de 50,0 %. Estos resultados indican que la dinámica de la enfermedad en el caballo criollo difiere entre zonas geográficas y revela que para formular estrategias de control y prevención se debería profundizar en los eventos fisiopatológicos, teniendo en cuenta VAIE, ambiente y fisiología de los animales.

IFNL4 genotype influences the rate of HIV-1 seroconversion in men who have sex with men

Meza Barreto, Giovanna | 2022

Individuals lacking interferon lambda 4 (IFNL4) protein due to a common null mutation (rs368234815) in the IFNL4 gene display higher resistance against several infections. The influence of IFNL4 on HIV-1 infection is still under discussion and conflicting results have been reported. This study intended to corroborate or refute the association of the null allele of IFNL4 and HIV-1 predisposition in a cohort of men who have sex with men (MSM). IFNL4 null genotype was assessed on 619 HIV-1-seronegative MSM who were followed for 36 months during a trial of a prophylactic vaccine against HIV-1. Of those, 257 individuals seroconverted during this period. A logistic regression model was constructed including demographic and IFNL4 genotype. In addition, a meta-analysis using data from the current study and other European populations was conducted. The null IFNL4 genotypes were correlated with lower HIV-1 seroconversion (Adjusted OR = 0.4 [95%CI: 0.2–0.8], P = 0.008) and longer time to seroconversion (889 vs. 938 days, P= 0.01). These results were validated by a meta-analysis incorporating data from other European populations and the result yielded a significant association of the IFNL4 null genotype under a dominant model with a lower probability of HIV-1 infection (OR=0.4 [95% CI: 0.3-0.6]; P= 1.3 x 10E-5). © 2022 The Author(s). Published by Informa UK Limited, trading as Taylor & Francis Group.

Investigación Bioquímica de Proteínas (INBIOPROT): Informe de actividades 2019-I Español

Rincón Cortés, Clara Andrea | 2019-05-08

Investigación Bioquímica de Proteínas (INBIOPROT): Informe de actividades 2020-II Español

Rincón Cortés, Clara Andrea | 2020-11-30

Investigación Bioquímica de Proteínas (INBIOPROT): Informe de actividades 2021-I

Rincón Cortés, Clara Andrea | 2021-06-24

Prediccción estructural y funcional de un fragmento de la proteína Gag del virus de leucósis bovina (VLB)

Molina Chávez, Ilgardo Guillermo | 2014

Colombia no tiene información sobre el tipo de Virus de la Leucósis Bovina que circula en las ganaderías, desconocimiento científico que complica la generación de estrategias de control y prevención de la enfermedad en el País. Teniendo en cuenta estas problemáticas y a partir de la caracterización proteómica de un fragmento del gen gag, se quiere identificar los motivos funcionales que posee el mismo. Para el desarrollo de este trabajo se tomó un fragmento del gen gag del VLB, obtenido por [Mesa et. al., 2013], para iniciar el análisis estructural y funcional de la proteína codificada por este fragmento, por medio de herramientas bioinformáticas. Se observó que existe 100% de identidad de 27 secuencias en estudio, teniendo en cuenta lo anterior se seleccionó una secuencia de aminoácidos correspondiente al código JQ480639.1, denominándola “Fragmento de la proteína Gag del Virus de Leucósis Bovina” (FGagVLB), compuesto por 128 residuos de aminoácidos, con un peso molecular de 13,94KDa y un punto isoeléctrico (pI) de 4.60, presenta dos comportamientos, tanto hidrofóbico como hidrofílico. Los motivos funcionales del FGagVLB obtenidos corresponden a proteínas implicadas en procesos de transformación de células infectadas por virus. Las características primarias y secundarias del FGagVLB permiten contar con una muy buena noción de su identidad y destacar algunas de sus propiedades dentro del marco de la proteómica y genómica. Los motivos funcionales específicos y determinados de la proteína Gag son pieza clave para la generación de posibles biomarcadores específicos de la enfermedad de Leucósis Bovina Enzoótica.

Técnica no convencional de extracción de ADN a partir de tejido embebido en parafina para uso en la reacción en cadena de la polimerasa

Ulloa, Juan Carlos | 2013-01

The paraffin-embedded tissues are samples resting in the pathology banks, storing important genetic information, useful for retrospective studies of epidemiology and molecular pathology and diagnosis of diseases in humans and animals. Among the methods described for extracting DNA from tissues in paraffin, few are successful in obtaining the genetic material which can be amplified above 200bp fragments by the PCR technique. This paper describes the experience of U.D.C.A ́s molecular biology laboratory, related to the application of a methodology recently used to extract DNA from paraffin-embedded tissue and which permits to be optimal amplified by PCR of a fragment to 600pb. Two techniques were used, extensively referenced to these samples, such as the phenol extraction protocol and the commercial kit from QIAGEN®, and also a third commonly used method for extracting DNA from blood samples, but not for tissue in paraffin, the technique of extraction or salting out salts. The extracted DNA amplifiable ability was evidenced to obtain a fragment of 600pb establishing a human gene. The results showed that extraction with phenol and commercial kit from QIAGEN ® achieved amplifications of a 21%, while the salt extraction method a 91%. This work reveals that an unconventional technique of DNA extraction from paraffin-embedded tissue can offer better performance than traditional methodologies.